国家中医药管理局亚健康干预技术实验室是2009年国家中医药管理局批准，依托湖南农业大学成立的国家级亚健康研究实验室（三级）。在中华中医药学会亚健康分会的直接指导下，实验室秉承“大项目、大平台、大成果”的发展思路，以传统中医药理论为指导，开展亚健康物质组基础、生物活性成分的分子营养学和营养基因组学研究。结合健康中国行动实施，努力在健康医学和转化医学领域推进中医药和现代科学相结合，坚持中西医并重，协调发展。加强国际合作，推动实验室开放发展，形成了以国家973项目主持人、国家新世纪人才和湖南省百人计划为核心的年轻研究团队。

实验室先后主持了国家973计划项目“生物种质创新与遗传改良的基础理论研究（2012CB723004）”，国家“十二五”科技支撑计划课题“调节脂代谢功能食品及功能性油脂开发关键技术研究与示范” （2012BAD33B11），国家自然科学基金面上项目“国家自然科学基金委面上项目基于比较基因组学的蛇足石杉内生真菌合成石杉碱甲机制研究（31471590）”，农业科技成果转化资金项目“珍稀药用菌深加工及高效综合利用集成与示范（2012GB2D200328）”，科技部国际合作项目“国家国际科技合作项目亚健康干预产品功能因子开发关键技术合作研究（2013DFG32060）”，澳大利亚特色植物引进与利用关键技术合作研究（2013DFA31790），教育部新世纪人才支持计划项目“人参皂甙对胰岛β细胞凋亡基因表达谱的影响（NCET-09-0141）”以及人事部留学生重点资助项目“人源化单克隆抗体治疗和预防糖尿病”等36个项目，总计经费达3000万，建成后的亚健康干预技术实验室占地面积1100平米，配备有气-质联用、液-质联用、扫描电子显微镜和透射电子显微镜等仪器设备。

实验室在建设中形成了丰富成果。通过省级鉴定的研究成果2项，市级成果1项；选育通过省级审定的新品种2个；获得国内外授权专利53项，在《Diabetologia》、《Endocrinology》、《Diabetes》等杂志发表高影响力论文120余篇，总他引用次数1447次。完成了九大仙草合成生物学研究体系的搭建，发布了全球首个灵芝全基因组精细图谱；发布了野生冬虫夏草虫体与子座的线粒体基因组，首次绘制了真菌线粒体基因组的DNA修饰图谱；首次以代谢组学为技术手段揭示了亚健康的物质组基础，通过省级鉴定的研究成果2项，选育通过省级审定的新品种2个。搭建集成了超临界流体、高速逆流、植物药发酵等多种提制技术平台，国内外授权发明专利22项，授权新型应用专利14项，通过PCT检索专利10项，共计53项，获湖南省技术发明奖1项、湖南省科技进步奖1项、长沙科技进步奖1项。